RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
UBE2C-204ENST00000356455 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
UBE2C-204ENST00000356455 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
UBE2C-204ENST00000356455 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.76■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 KIF3BO15066 747 aa29.76■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.75■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 MBD5Q9P267 1494 aa29.74■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 TIAM1Q13009 1591 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.71■■■□□ 2.35
UBE2C-204ENST00000356455 PZPP20742 1482 aa29.69■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.69■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.67■■■□□ 2.34
UBE2C-204ENST00000356455 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 MIA2Q96PC5 1412 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 CEP162Q5TB80 1403 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 NLRP1Q9C000 1473 aa29.61■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.6■■■□□ 2.33
UBE2C-204ENST00000356455 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.57■■■□□ 2.32
UBE2C-204ENST00000356455 MED14O60244 1454 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2C-204ENST00000356455 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2C-204ENST00000356455 DEPDC5O75140 1603 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2C-204ENST00000356455 IQGAP1P46940 1657 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 TSPY4P0CV99 314 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 TSPY10P0CW01 314 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 ALKQ9UM73 1620 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 NCOA2Q15596 1464 aa29.49■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.45■■■□□ 2.31
UBE2C-204ENST00000356455 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
UBE2C-204ENST00000356455 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2C-204ENST00000356455 ABCC3O15438 1527 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2C-204ENST00000356455 SYNMO15061 1565 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2C-204ENST00000356455 ERVK-7P63135 1459 aa29.38■■■□□ 2.29
UBE2C-204ENST00000356455 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
UBE2C-204ENST00000356455 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.3■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.29■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.28■■■□□ 2.28
UBE2C-204ENST00000356455 CEP152O94986 1710 aa29.26■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 LTKP29376 864 aa29.26■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 EID1Q9Y6B2 187 aa29.25■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.24■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.21■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 SLIT1O75093 1534 aa29.2■■■□□ 2.27
UBE2C-204ENST00000356455 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.19■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.18■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.18■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.14■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.13■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.12■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM94Q12767 1356 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 KIF15Q9NS87 1388 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 POTEAQ6S8J7 498 aa29.1■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 PIK3C2BO00750 1634 aa29.09■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.09■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
UBE2C-204ENST00000356455 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.07■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 KCNA6P17658 529 aa29.06■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 ERBINQ96RT1 1412 aa29.05■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 KANK1Q14678 1352 aa29.05■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.04■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.03■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.02■■■□□ 2.24
UBE2C-204ENST00000356455 IDI1Q13907 227 aa29■■■□□ 2.23
UBE2C-204ENST00000356455 BCANQ96GW7 911 aa29■■■□□ 2.23
UBE2C-204ENST00000356455 ABCC5O15440 1437 aa28.98■■■□□ 2.23
UBE2C-204ENST00000356455 MAP3K1Q13233 1512 aa28.98■■■□□ 2.23
UBE2C-204ENST00000356455 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.96■■■□□ 2.23
UBE2C-204ENST00000356455 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 MSH6P52701 1360 aa28.94■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 TET3O43151 1660 aa28.93■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 DAPK1P53355 1430 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 SLAIN2Q9P270 581 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.89■■■□□ 2.22
UBE2C-204ENST00000356455 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.89■■■□□ 2.21
UBE2C-204ENST00000356455 PHLPP1O60346 1717 aa28.88■■■□□ 2.21
UBE2C-204ENST00000356455 ADGRB3O60242 1522 aa28.88■■■□□ 2.21
UBE2C-204ENST00000356455 JCADQ9P266 1359 aa28.88■■■□□ 2.21
UBE2C-204ENST00000356455 NWD1Q149M9 1564 aa28.87■■■□□ 2.21
UBE2C-204ENST00000356455 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.87■■■□□ 2.21
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