RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 HRCP23327 699 aa42.66■■■■■ 4.42
PPP1CC-202ENST00000340766 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.65■■■■■ 4.42
PPP1CC-202ENST00000340766 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
PPP1CC-202ENST00000340766 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.58■■■■■ 4.41
PPP1CC-202ENST00000340766 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP1CC-202ENST00000340766 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
PPP1CC-202ENST00000340766 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.52■■■■■ 4.4
PPP1CC-202ENST00000340766 TRIM52Q96A61 297 aa42.5■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 NUP155O75694 1391 aa42.49■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 GGT6Q6P531 493 aa42.49■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.391e-6■■□□□ 12.7
PPP1CC-202ENST00000340766 CEP152O94986 1710 aa42.47■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 KANK1Q14678 1352 aa42.47■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.46■■■■■ 4.39
PPP1CC-202ENST00000340766 PZPP20742 1482 aa42.43■■■■■ 4.38
PPP1CC-202ENST00000340766 ABCC3O15438 1527 aa42.4■■■■■ 4.38
PPP1CC-202ENST00000340766 MLECQ14165 292 aa42.4■■■■■ 4.38
PPP1CC-202ENST00000340766 TET3O43151 1660 aa42.39■■■■■ 4.38
PPP1CC-202ENST00000340766 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.39■■■■■ 4.38
PPP1CC-202ENST00000340766 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.36■■■■■ 4.37
PPP1CC-202ENST00000340766 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PPP1CC-202ENST00000340766 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP1CC-202ENST00000340766 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.34■■■■■ 4.37
PPP1CC-202ENST00000340766 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.29■■■■■ 4.36
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PPP1CC-202ENST00000340766 MROH2AA6NES4 1674 aa42.27■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 E9PCH4 1651 aa42.27■■■■■ 4.36
PPP1CC-202ENST00000340766 MADDQ8WXG6 1647 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP1CC-202ENST00000340766 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.24■■■■■ 4.35
PPP1CC-202ENST00000340766 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PPP1CC-202ENST00000340766 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
PPP1CC-202ENST00000340766 PKD2Q13563 968 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP1CC-202ENST00000340766 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.14■■■■■ 4.34
PPP1CC-202ENST00000340766 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
PPP1CC-202ENST00000340766 NPATQ14207 1427 aa42.13■■■■■ 4.33
PPP1CC-202ENST00000340766 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PPP1CC-202ENST00000340766 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.1■■■■■ 4.33
PPP1CC-202ENST00000340766 C3P01024 1663 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP1CC-202ENST00000340766 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.06■■■■■ 4.32
PPP1CC-202ENST00000340766 ZMYM3Q14202 1370 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP1CC-202ENST00000340766 FOXD1Q16676 465 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP1CC-202ENST00000340766 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
PPP1CC-202ENST00000340766 TRPM2O94759 1503 aa41.97■■■■■ 4.31
PPP1CC-202ENST00000340766 PTPRTO14522 1441 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP1CC-202ENST00000340766 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP1CC-202ENST00000340766 ERVK-7P63135 1459 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.94■■■■■ 4.31
PPP1CC-202ENST00000340766 NOS1P29475 1434 aa41.93■■■■■ 4.3
PPP1CC-202ENST00000340766 PLA2R1Q13018 1463 aa41.93■■■■■ 4.3
PPP1CC-202ENST00000340766 SYNMO15061 1565 aa41.91■■■■■ 4.3
PPP1CC-202ENST00000340766 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.91■■■■■ 4.3
PPP1CC-202ENST00000340766 PTPRMP28827 1452 aa41.88■■■■■ 4.29
PPP1CC-202ENST00000340766 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
PPP1CC-202ENST00000340766 CLTCL1P53675 1640 aa41.84■■■■■ 4.29
PPP1CC-202ENST00000340766 PIK3C2BO00750 1634 aa41.83■■■■■ 4.29
PPP1CC-202ENST00000340766 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.81■■■■■ 4.28
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.8■■■■■ 4.28
PPP1CC-202ENST00000340766 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.8■■■■■ 4.28
PPP1CC-202ENST00000340766 TNRQ92752 1358 aa41.76■■■■■ 4.28
PPP1CC-202ENST00000340766 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.75■■■■■ 4.27
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF1BO60333 1816 aa41.74■■■■■ 4.27
PPP1CC-202ENST00000340766 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.7■■■■■ 4.27
PPP1CC-202ENST00000340766 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.68■■■■■ 4.26
PPP1CC-202ENST00000340766 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.67■■■■■ 4.26
PPP1CC-202ENST00000340766 NLRP1Q9C000 1473 aa41.64■■■■■ 4.26
PPP1CC-202ENST00000340766 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 NEUROD1Q13562 356 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ADGRB3O60242 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 IDI1Q13907 227 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
PPP1CC-202ENST00000340766 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP1CC-202ENST00000340766 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.54■■■■■ 4.24
PPP1CC-202ENST00000340766 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
PPP1CC-202ENST00000340766 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.51■■■■■ 4.24
PPP1CC-202ENST00000340766 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
PPP1CC-202ENST00000340766 TONSLQ96HA7 1378 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP1CC-202ENST00000340766 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP1CC-202ENST00000340766 IFT172Q9UG01 1749 aa41.43■■■■■ 4.22
PPP1CC-202ENST00000340766 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.42■■■■■ 4.22
PPP1CC-202ENST00000340766 PPLO60437 1756 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP1CC-202ENST00000340766 RGL3Q3MIN7 710 aa41.38■■■■■ 4.21
PPP1CC-202ENST00000340766 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.36■■■■■ 4.21
PPP1CC-202ENST00000340766 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.35■■■■■ 4.21
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
PPP1CC-202ENST00000340766 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.31■■■■■ 4.2
PPP1CC-202ENST00000340766 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.27■■■■■ 4.2
PPP1CC-202ENST00000340766 SLIT1O75093 1534 aa41.27■■■■■ 4.2
PPP1CC-202ENST00000340766 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
PPP1CC-202ENST00000340766 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.25■■■■■ 4.19
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