RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328739.5

VMO1-201, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-201ENST00000328739 NAIPQ13075 1403 aa29.68■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.67■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 PTPRMP28827 1452 aa29.67■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.66■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.65■■■□□ 2.34
VMO1-201ENST00000328739 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.63■■■□□ 2.33
VMO1-201ENST00000328739 HFM1A2PYH4 1435 aa29.63■■■□□ 2.33
VMO1-201ENST00000328739 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.62■■■□□ 2.33
VMO1-201ENST00000328739 ZMYM3Q14202 1370 aa29.59■■■□□ 2.33
VMO1-201ENST00000328739 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
VMO1-201ENST00000328739 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.57■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 KANK1Q14678 1352 aa29.56■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.56■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 DEPDC5O75140 1603 aa29.56■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 ABCC3O15438 1527 aa29.55■■■□□ 2.32
VMO1-201ENST00000328739 NUP155O75694 1391 aa29.51■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.5■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 UNC13BO14795 1591 aa29.49■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.49■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.49■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 C3P01024 1663 aa29.48■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 CEP152O94986 1710 aa29.48■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 MROH2AA6NES4 1674 aa29.47■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 TRIM52Q96A61 297 aa29.47■■■□□ 2.31
VMO1-201ENST00000328739 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
VMO1-201ENST00000328739 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.43■■■□□ 2.3
VMO1-201ENST00000328739 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.41■■■□□ 2.3
VMO1-201ENST00000328739 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.41■■■□□ 2.3
VMO1-201ENST00000328739 PZPP20742 1482 aa29.41■■■□□ 2.3
VMO1-201ENST00000328739 NPATQ14207 1427 aa29.38■■■□□ 2.29
VMO1-201ENST00000328739 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.37■■■□□ 2.29
VMO1-201ENST00000328739 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.37■■■□□ 2.29
VMO1-201ENST00000328739 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.34■■■□□ 2.29
VMO1-201ENST00000328739 TNRQ92752 1358 aa29.32■■■□□ 2.28
VMO1-201ENST00000328739 ERVK-7P63135 1459 aa29.31■■■□□ 2.28
VMO1-201ENST00000328739 TET3O43151 1660 aa29.31■■■□□ 2.28
VMO1-201ENST00000328739 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
VMO1-201ENST00000328739 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.26■■■□□ 2.28
VMO1-201ENST00000328739 PKD2Q13563 968 aa29.26■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.26■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.25■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 HRCP23327 699 aa29.24■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.24■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 E9PCH4 1651 aa29.23■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.23■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 NOS1P29475 1434 aa29.22■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 HSPA2P54652 639 aa29.22■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 FOXD1Q16676 465 aa29.22■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
VMO1-201ENST00000328739 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.2■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.19■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 IDI1Q13907 227 aa29.16■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 SYNMO15061 1565 aa29.16■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 NLRP1Q9C000 1473 aa29.14■■■□□ 2.26
VMO1-201ENST00000328739 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.13■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 PTPRTO14522 1441 aa29.11■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.1■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.1■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 PLA2R1Q13018 1463 aa29.09■■■□□ 2.25
VMO1-201ENST00000328739 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.06■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 PIK3C2BO00750 1634 aa29.03■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.03■■■□□ 2.24
VMO1-201ENST00000328739 TRPM2O94759 1503 aa29.01■■■□□ 2.23
VMO1-201ENST00000328739 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.97■■■□□ 2.23
VMO1-201ENST00000328739 CLTCL1P53675 1640 aa28.96■■■□□ 2.23
VMO1-201ENST00000328739 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.96■■■□□ 2.23
VMO1-201ENST00000328739 ADGRB3O60242 1522 aa28.95■■■□□ 2.23
VMO1-201ENST00000328739 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.92■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.91■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.91■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.89■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.89■■■□□ 2.22
VMO1-201ENST00000328739 LTKP29376 864 aa28.88■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.88■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.86■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 STRCQ7RTU9 1775 aa28.85■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 SLIT1O75093 1534 aa28.85■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 EID1Q9Y6B2 187 aa28.83■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.83■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.83■■■□□ 2.21
VMO1-201ENST00000328739 RGL3Q3MIN7 710 aa28.81■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms