RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.59■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 DEPDC5O75140 1603 aa32.58■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.58■■■□□ 2.81
CTU2-201ENST00000312060 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.57■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 REREQ9P2R6 1566 aa32.56■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 PZPP20742 1482 aa32.56■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.51■■■□□ 2.8
CTU2-201ENST00000312060 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.5■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.49■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.48■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 GGT6Q6P531 493 aa32.46■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 KANK1Q14678 1352 aa32.46■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.46■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 AGLP35573 1532 aa32.46■■■□□ 2.79
CTU2-201ENST00000312060 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.42■■■□□ 2.78
CTU2-201ENST00000312060 PKD2Q13563 968 aa32.42■■■□□ 2.78
CTU2-201ENST00000312060 FOXD1Q16676 465 aa32.4■■■□□ 2.78
CTU2-201ENST00000312060 CEP152O94986 1710 aa32.37■■■□□ 2.77
CTU2-201ENST00000312060 TET3O43151 1660 aa32.35■■■□□ 2.77
CTU2-201ENST00000312060 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CTU2-201ENST00000312060 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.32■■■□□ 2.77
CTU2-201ENST00000312060 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.3■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.29■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 E9PCH4 1651 aa32.29■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 ABCC3O15438 1527 aa32.29■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 MLECQ14165 292 aa32.28■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.27■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.27■■■□□ 2.76
CTU2-201ENST00000312060 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.24■■■□□ 2.75
CTU2-201ENST00000312060 NEUROD1Q13562 356 aa32.24■■■□□ 2.75
CTU2-201ENST00000312060 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CTU2-201ENST00000312060 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.23■■■□□ 2.75
CTU2-201ENST00000312060 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CTU2-201ENST00000312060 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.16■■■□□ 2.74
CTU2-201ENST00000312060 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CTU2-201ENST00000312060 NPATQ14207 1427 aa32.14■■■□□ 2.74
CTU2-201ENST00000312060 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CTU2-201ENST00000312060 PLA2R1Q13018 1463 aa32.13■■■□□ 2.73
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.11■■■□□ 2.73
CTU2-201ENST00000312060 PTPRTO14522 1441 aa32.1■■■□□ 2.73
CTU2-201ENST00000312060 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.07■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 TRPM2O94759 1503 aa32.07■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.05■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.05■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.04■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 TONSLQ96HA7 1378 aa32.03■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 MROH2AA6NES4 1674 aa32.01■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.01■■■□□ 2.72
CTU2-201ENST00000312060 ZMYM3Q14202 1370 aa32.01■■■□□ 2.71
CTU2-201ENST00000312060 NOS1P29475 1434 aa31.98■■■□□ 2.71
CTU2-201ENST00000312060 CLTCL1P53675 1640 aa31.98■■■□□ 2.71
CTU2-201ENST00000312060 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 KIF1BO60333 1816 aa31.93■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.93■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 SYNMO15061 1565 aa31.93■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.93■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 ERVK-7P63135 1459 aa31.93■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 MADDQ8WXG6 1647 aa31.92■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.91■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 C3P01024 1663 aa31.89■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.89■■■□□ 2.7
CTU2-201ENST00000312060 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 PIK3C2BO00750 1634 aa31.87■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.85■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 RGL3Q3MIN7 710 aa31.84■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.83■■■□□ 2.69
CTU2-201ENST00000312060 IDI1Q13907 227 aa31.81■■■□□ 2.68
CTU2-201ENST00000312060 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.8■■■□□ 2.68
CTU2-201ENST00000312060 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
CTU2-201ENST00000312060 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.78■■■□□ 2.68
CTU2-201ENST00000312060 TNRQ92752 1358 aa31.76■■■□□ 2.68
CTU2-201ENST00000312060 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.76■■■□□ 2.67
CTU2-201ENST00000312060 ADGRB3O60242 1522 aa31.75■■■□□ 2.67
CTU2-201ENST00000312060 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.74■■■□□ 2.67
CTU2-201ENST00000312060 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.72■■■□□ 2.67
CTU2-201ENST00000312060 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.7■■■□□ 2.66
CTU2-201ENST00000312060 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CTU2-201ENST00000312060 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.67■■■□□ 2.66
CTU2-201ENST00000312060 IFT172Q9UG01 1749 aa31.65■■■□□ 2.66
CTU2-201ENST00000312060 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CTU2-201ENST00000312060 PTPRMP28827 1452 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 STAC3Q96MF2 364 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 PPLO60437 1756 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 NLRP1Q9C000 1473 aa31.62■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.62■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.61■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.58■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.57■■■□□ 2.65
CTU2-201ENST00000312060 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.56■■■□□ 2.64
CTU2-201ENST00000312060 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms