RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXNC1O60486 1568 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.81□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TNRQ92752 1358 aa12.79□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF39Q9H2S5 420 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1B-201ENST00000296642 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP1Q9C000 1473 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PZPP20742 1482 aa12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF3BO15066 747 aa12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.73□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MED14O60244 1454 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 DEPDC5O75140 1603 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MIA2Q96PC5 1412 aa12.71□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNMO15061 1565 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IQGAP1P46940 1657 aa12.68□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY4P0CV99 314 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPY10P0CW01 314 aa12.67□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD5Q9P267 1494 aa12.65□□□□□ -0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 EID1Q9Y6B2 187 aa12.64□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP162Q5TB80 1403 aa12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TIAM1Q13009 1591 aa12.61□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ALKQ9UM73 1620 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.6□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.59□□□□□ -0.39
PGGT1B-201ENST00000296642 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.58□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.57□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-7P63135 1459 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.56□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC3O15438 1527 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.55□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEAQ6S8J7 498 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLIT1O75093 1534 aa12.52□□□□□ -0.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA2Q15596 1464 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA6P17658 529 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MSH6P52701 1360 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LTKP29376 864 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM94Q12767 1356 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KANK1Q14678 1352 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 JCADQ9P266 1359 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BCANQ96GW7 911 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.47□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.46□□□□□ -0.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP152O94986 1710 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAIN2Q9P270 581 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PHLPP1O60346 1717 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf37Q86TY3 774 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 ERBINQ96RT1 1412 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3C2BO00750 1634 aa12.41□□□□□ -0.42
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