RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.6	■■■□□ 2.97
FAM53B-201	ENST00000280780	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.59	■■■□□ 2.97
FAM53B-201	ENST00000280780	NAIP	Q13075	1403 aa		33.59	■■■□□ 2.97
FAM53B-201	ENST00000280780	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.58	■■■□□ 2.97
FAM53B-201	ENST00000280780	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
FAM53B-201	ENST00000280780	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
FAM53B-201	ENST00000280780	C3	P01024	1663 aa		33.52	■■■□□ 2.96
FAM53B-201	ENST00000280780	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.49	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.48	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.48	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
FAM53B-201	ENST00000280780	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM53B-201	ENST00000280780	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FAM53B-201	ENST00000280780	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.38	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCC3	O15438	1527 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
FAM53B-201	ENST00000280780	CEP152	O94986	1710 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	HSPA2	P54652	639 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	UNC13B	O14795	1591 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM53B-201	ENST00000280780	NPAT	Q14207	1427 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	HRC	P23327	699 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	PZP	P20742	1482 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM53B-201	ENST00000280780	KANK1	Q14678	1352 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAM53B-201	ENST00000280780	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAM53B-201	ENST00000280780	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM53B-201	ENST00000280780	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	TNR	Q92752	1358 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	NUP155	O75694	1391 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.07	■■■□□ 2.89
FAM53B-201	ENST00000280780	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
FAM53B-201	ENST00000280780	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FAM53B-201	ENST00000280780	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
FAM53B-201	ENST00000280780	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780	TET3	O43151	1660 aa		33	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.97	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780		E9PCH4	1651 aa		32.95	■■■□□ 2.87
FAM53B-201	ENST00000280780	NOS1	P29475	1434 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.93	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	SYNM	O15061	1565 aa		32.93	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	IDI1	Q13907	227 aa		32.9	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
FAM53B-201	ENST00000280780	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.88	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	PKD2	Q13563	968 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	FOXD1	Q16676	465 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
FAM53B-201	ENST00000280780	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.82	■■■□□ 2.84
FAM53B-201	ENST00000280780	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
FAM53B-201	ENST00000280780	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FAM53B-201	ENST00000280780	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FAM53B-201	ENST00000280780	PTPRT	O14522	1441 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FAM53B-201	ENST00000280780	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FAM53B-201	ENST00000280780	LTK	P29376	864 aa		32.7	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.7	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	TRPM2	O94759	1503 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	SLIT1	O75093	1534 aa		32.64	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.64	■■■□□ 2.82
FAM53B-201	ENST00000280780	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
FAM53B-201	ENST00000280780	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FAM53B-201	ENST00000280780	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FAM53B-201	ENST00000280780	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FAM53B-201	ENST00000280780	MED14	O60244	1454 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FAM53B-201	ENST00000280780	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8

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