RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 DISP1Q96F81 1524 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.63□□□□□ -0.55
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HERC3-201ENST00000264345 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.61□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.6□□□□□ -0.55
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HERC3-201ENST00000264345 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 PZPP20742 1482 aa11.58□□□□□ -0.56
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HERC3-201ENST00000264345 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.56□□□□□ -0.56
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HERC3-201ENST00000264345 NUP160Q12769 1436 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 CCDC184Q52MB2 194 aa11.55□□□□□ -0.56
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HERC3-201ENST00000264345 PANK3Q9H999 370 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 NBR1Q14596 966 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 NGEFQ8N5V2 710 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 MS4A1P11836 297 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 ATP10BO94823 1461 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-201ENST00000264345 KDM6BO15054 1643 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 ERBINQ96RT1 1412 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA2Q08379 1002 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 CEP170Q5SW79 1584 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 BECN1Q14457 450 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 KIF3BO15066 747 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 ABCA8O94911 1581 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HERC3-201ENST00000264345 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 MORC1Q86VD1 984 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-201ENST00000264345 MBD5Q9P267 1494 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-201ENST00000264345 INSRP06213 1382 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 PDE4AP27815 886 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 USP35Q9P2H5 1018 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 E9PSI1 815 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 KDM5CP41229 1560 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.43□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 BCL11AQ9H165 835 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 CRBNQ96SW2 442 aa11.41□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R1AP30153 589 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
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HERC3-201ENST00000264345 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 PLCH2O75038 1416 aa11.4□□□□□ -0.58
HERC3-201ENST00000264345 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.4□□□□□ -0.59
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HERC3-201ENST00000264345 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
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HERC3-201ENST00000264345 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.39□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.38□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
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HERC3-201ENST00000264345 ABCC2Q92887 1545 aa11.37□□□□□ -0.59
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HERC3-201ENST00000264345 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.37□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 PREX2Q70Z35 1606 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 MSH5O43196 834 aa11.36□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.35□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
HERC3-201ENST00000264345 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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