RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219551.2

RHBDL1-201, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDL1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-201ENST00000219551 TRIM52Q96A61 297 aa28.33■■■□□ 2.13
RHBDL1-201ENST00000219551 UNC13BO14795 1591 aa28.33■■■□□ 2.13
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RHBDL1-201ENST00000219551 GGT6Q6P531 493 aa28.3■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 NUP155O75694 1391 aa28.29■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.28■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
RHBDL1-201ENST00000219551 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.26■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 KANK1Q14678 1352 aa28.25■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.24■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.23■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.22■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 MLECQ14165 292 aa28.21■■■□□ 2.11
RHBDL1-201ENST00000219551 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.2■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 PZPP20742 1482 aa28.19■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.19■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.18■■■□□ 2.1
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RHBDL1-201ENST00000219551 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.15■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCC3O15438 1527 aa28.14■■■□□ 2.09
RHBDL1-201ENST00000219551 CEP152O94986 1710 aa28.13■■■□□ 2.09
RHBDL1-201ENST00000219551 TET3O43151 1660 aa28.11■■■□□ 2.09
RHBDL1-201ENST00000219551 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
RHBDL1-201ENST00000219551 PKD2Q13563 968 aa28.09■■■□□ 2.09
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RHBDL1-201ENST00000219551 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.06■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.05■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.03■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 E9PCH4 1651 aa28.03■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.03■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.02■■■□□ 2.08
RHBDL1-201ENST00000219551 FOXD1Q16676 465 aa28.01■■■□□ 2.07
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RHBDL1-201ENST00000219551 NPATQ14207 1427 aa27.99■■■□□ 2.07
RHBDL1-201ENST00000219551 MADDQ8WXG6 1647 aa27.99■■■□□ 2.07
RHBDL1-201ENST00000219551 ZMYM3Q14202 1370 aa27.98■■■□□ 2.07
RHBDL1-201ENST00000219551 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.96■■■□□ 2.07
RHBDL1-201ENST00000219551 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
RHBDL1-201ENST00000219551 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.94■■■□□ 2.06
RHBDL1-201ENST00000219551 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
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RHBDL1-201ENST00000219551 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.89■■■□□ 2.06
RHBDL1-201ENST00000219551 PLA2R1Q13018 1463 aa27.89■■■□□ 2.05
RHBDL1-201ENST00000219551 C3P01024 1663 aa27.88■■■□□ 2.05
RHBDL1-201ENST00000219551 NOS1P29475 1434 aa27.88■■■□□ 2.05
RHBDL1-201ENST00000219551 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.88■■■□□ 2.05
RHBDL1-201ENST00000219551 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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RHBDL1-201ENST00000219551 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.82■■■□□ 2.04
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RHBDL1-201ENST00000219551 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.8■■■□□ 2.04
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RHBDL1-201ENST00000219551 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.77■■■□□ 2.04
RHBDL1-201ENST00000219551 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.77■■■□□ 2.04
RHBDL1-201ENST00000219551 TNRQ92752 1358 aa27.75■■■□□ 2.03
RHBDL1-201ENST00000219551 NEUROD1Q13562 356 aa27.75■■■□□ 2.03
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RHBDL1-201ENST00000219551 NLRP1Q9C000 1473 aa27.66■■■□□ 2.02
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RHBDL1-201ENST00000219551 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.63■■■□□ 2.01
RHBDL1-201ENST00000219551 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.63■■■□□ 2.01
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RHBDL1-201ENST00000219551 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.6■■■□□ 2.01
RHBDL1-201ENST00000219551 TONSLQ96HA7 1378 aa27.6■■■□□ 2.01
RHBDL1-201ENST00000219551 ADGRB3O60242 1522 aa27.59■■■□□ 2.01
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RHBDL1-201ENST00000219551 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.52■■■□□ 2
RHBDL1-201ENST00000219551 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
RHBDL1-201ENST00000219551 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.51■■□□□ 1.99
RHBDL1-201ENST00000219551 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RHBDL1-201ENST00000219551 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.49■■□□□ 1.99
RHBDL1-201ENST00000219551 STAC3Q96MF2 364 aa27.48■■□□□ 1.99
RHBDL1-201ENST00000219551 IFT172Q9UG01 1749 aa27.45■■□□□ 1.98
RHBDL1-201ENST00000219551 PPLO60437 1756 aa27.44■■□□□ 1.98
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