RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 GFPT2O94808 682 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ALADP13716 330 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 FGFR4P22455 802 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CFAP73A6NFT4 308 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 HOXD13P35453 343 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SNX3O60493 162 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 DIAPH2O60879 1101 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ABCB4P21439 1286 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ARSHQ5FYA8 562 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 C18orf8Q96DM3 657 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ECT2Q9H8V3 914 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CCDC169A6NNP5 214 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 AKAP3O75969 853 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 LRRC14Q15048 493 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ALG3Q92685 438 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SPDL1Q96EA4 605 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KRT16P08779 473 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CDK8P49336 464 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CASP4P49662 377 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CNGA2Q16280 664 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GCNT4Q9P109 453 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GRIK3Q13003 919 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ERICH1Q86X53 443 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PPATQ06203 517 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PLS1Q14651 629 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MGARPQ8TDB4 240 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NLRP3Q96P20 1036 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PNMA3Q9UL41 463 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 EVI5O60447 810 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RFC4P35249 363 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 STAT3P40763 770 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NPEPPSP55786 919 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MAPK7Q13164 816 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 HYIQ5T013 277 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 AGTP01019 485 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KRT13P13646 458 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GALNTL6Q49A17 601 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NCANO14594 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CREB1P16220 341 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 GCKP35557 465 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PTGIRP43119 386 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 RFFLQ8WZ73 363 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 INTUQ9ULD6 942 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 ATP8B3O60423 1300 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 POTEFA5A3E0 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 MARCH6O60337 910 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 POTEIP0CG38 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 POTEGQ6S5H5 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 VPS36Q86VN1 386 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 PALB2Q86YC2 1186 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 SLC35C1Q96A29 364 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-222ENST00000639501 COG5Q9UP83 839 aa22.16■■□□□ 1.14
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