RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 WNK4Q96J92 1243 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.41■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 ENTPD3O75355 529 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 COPB2P35606 906 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 PALB2Q86YC2 1186 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 FAM20AQ96MK3 541 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 CNTNAP1P78357 1384 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 PSMD10O75832 226 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 EYA4O95677 639 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 GUCY2DQ02846 1103 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 KCTD16Q68DU8 428 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 IQCEQ6IPM2 695 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 NFU1Q9UMS0 254 aa16.4■□□□□ 0.22
CTIF-205ENST00000587860 CALCAP01258 141 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PRKG1Q13976 671 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 WDR93Q6P2C0 686 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ANO9A1A5B4 782 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 MYO1FO00160 1098 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PAFAH1B1P43034 410 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TTLL6Q8N841 843 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 GOPCQ9HD26 462 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 NPEPPSP55786 919 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 C8orf74Q6P047 294 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 NSMFQ6X4W1 530 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.39■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 WNT10BO00744 389 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 HIP1RO75146 1068 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CXCL9Q07325 125 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EPHA7Q15375 998 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 DLK2Q6UY11 383 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 FAM151AQ8WW52 585 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 VCPKMTQ9H867 229 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PARVGQ9HBI0 331 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 COL4A5P29400 1685 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 AGPSO00116 658 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CEP104O60308 925 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 AP1G2O75843 785 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 LCA5LO95447 670 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 RXRBP28702 533 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CIITAP33076 1130 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 RASA3Q14644 834 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 NAB2Q15742 525 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 SIX2Q9NPC8 291 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.38■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 EXOC3O60645 756 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ATP9AO75110 1047 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB7AO95365 584 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PEX19P40855 299 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PRELPP51888 382 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 KAT5Q92993 513 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CENPHQ9H3R5 247 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 NAGPAQ9UK23 515 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.37■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PDXKO00764 312 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms