RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581761.5

MKS1-211, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 812 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-211ENST00000581761 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.08■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.08■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CENPFP49454 3210 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TGFB1I1O43294 461 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 KCNA4P22459 653 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FECHP22830 423 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PTPN14Q15678 1187 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 NFIL3Q16649 462 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ACCSQ96QU6 501 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 STRA6Q9BX79 667 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PORCNQ9H237 461 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MYH11P35749 1972 aa16.07■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PPP1R37O75864 691 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ATG7O95352 703 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 XKR3Q5GH77 459 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FIGNQ5HY92 759 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ERO1AQ96HE7 468 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GBP3Q9H0R5 595 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.06■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 A0A1W2PQJ5 194 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ASB14A6NK59 587 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 AKAP3O75969 853 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 GGPS1O95749 300 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 OATP04181 439 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TGFB3P10600 412 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PEX3P56589 373 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ZBED6P86452 979 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MTF1Q14872 753 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 NEK11Q8NG66 645 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 KIFAP3Q92845 792 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 DNAJC7Q99615 494 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TMEM206Q9H813 350 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 TRIM17Q9Y577 477 aa16.05■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CCDC169A6NNP5 214 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 SLC16A4O15374 487 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 DGAT1O75907 488 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CASP4P49662 377 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CYP2J2P51589 502 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 NCKAP1LP55160 1127 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 LY6KQ17RY6 165 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MTERF2Q49AM1 385 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 METTL7BQ6UX53 244 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MORC4Q8TE76 937 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 DESI2Q9BSY9 194 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MKS1-211ENST00000581761 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms