RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRDL2Q6WN34 429 aa36.8■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SQORQ9Y6N5 450 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACRP10323 421 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf59Q7L2K0 433 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHPN2Q8IUC4 686 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R16BQ96T49 567 aa36.8■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO47Q5MNV8 452 aa36.79■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa36.79■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC15Q8TF66 581 aa36.79■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS10Q9H324 1103 aa36.79■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRO3102Q9H379 93 aa36.79■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STK17AQ9UEE5 414 aa36.79■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDHR5Q9HBB8 845 aa36.78■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDPD2Q9HCC8 539 aa36.78■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF365Q70YC5 407 aa36.76■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAEAQ7L5Y9 396 aa36.76■■■■□ 3.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP7Q8WX94 980 aa36.76■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa36.75■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf186Q6ZWK4 172 aa36.75■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DBF4BQ8NFT6 615 aa36.74■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WZ62 844 aa36.73■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SEPT8Q92599 483 aa36.73■■■■□ 3.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIFAP3Q92845 792 aa36.72■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GUCY2CP25092 1073 aa36.71■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD52P31358 61 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU5F1BQ06416 359 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAK2Q13177 524 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 HERVK_113Q902F9 699 aa36.69■■■■□ 3.46
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