RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	HES6	Q96HZ4	224 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	AMFR	Q9UKV5	643 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SLX4	Q8IY92	1834 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	NCAN	O14594	1321 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM253	P0C7T8	217 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY2C	P25092	1073 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GALC	P54803	685 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-9	P63128	1117 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ODR4	Q5SWX8	454 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GJB7	Q6PEY0	223 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	NEK9	Q8TD19	979 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RFFL	Q8WZ73	363 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FIZ1	Q96SL8	496 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	POLD4	Q9HCU8	107 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		20.02	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G6	O60733	806 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CLUL1	Q15846	466 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		20.02	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R5E	Q16537	467 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1E	Q8WY54	764 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		20.01	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ZEB2	O60315	1214 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ECE1	P42892	770 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CCT5	P48643	541 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	MTMR3	Q13615	1198 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	FAM160B2	Q86V87	743 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
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RRN3-205	ENST00000563559	MYL7	Q01449	175 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ALCAM	Q13740	583 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD16	Q68DU8	428 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC174	Q6PII3	467 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CNKSR1	Q969H4	720 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
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RRN3-205	ENST00000563559	PLAA	Q9Y263	795 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		20	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		19.99	■□□□□ 0.79
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RRN3-205	ENST00000563559	TRADD	Q15628	312 aa		19.99	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	AOC3	Q16853	763 aa		19.99	■□□□□ 0.79
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RRN3-205	ENST00000563559	LXN	Q9BS40	222 aa		19.99	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM51	Q9NW97	253 aa		19.99	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
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RRN3-205	ENST00000563559	BCR	P11274	1271 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	KRT13	P13646	458 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CBWD6	Q4V339	395 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		19.98	■□□□□ 0.79
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		19.98	■□□□□ 0.79

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