RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	MICU3	Q86XE3	530 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	METTL13	Q8N6R0	699 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	MAP7D2	Q96T17	732 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	OSMR	Q99650	979 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DACT1	Q9NYF0	836 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	STK39	Q9UEW8	545 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		7.76	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SMCO2	A6NFE2	343 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	HIDE1	A8MVS5	230 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	C22orf31	O95567	290 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	BRD1	O95696	1058 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PSAP	P07602	524 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CYP3A4	P08684	503 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	RPS6KB1	P23443	525 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ADCY7	P51828	1080 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	KRT32	Q14532	448 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	BRF1	Q92994	677 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TMEM169	Q96HH4	297 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	FAM167A	Q96KS9	214 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CHST12	Q9NRB3	414 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	BARHL2	Q9NY43	387 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.75	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PRR23A	A6NEV1	266 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	FAM86B1	E9PN63	330 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CXCL14	O95715	111 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	VTN	P04004	478 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SKI	P12755	728 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ATP4A	P20648	1035 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	RCAN1	P53805	252 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	STK3	Q13188	491 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	KCNB2	Q92953	911 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	POMK	Q9H5K3	350 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	HCST	Q9UBK5	93 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	AKT3	Q9Y243	479 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	KAT6A	Q92794	2004 aa		7.74	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	REV3L	O60673	3130 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	ESYT2	A0FGR8	921 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
CS-233	ENST00000552688	PSMA5	P28066	241 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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