RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520036.1

ACTBP6-201, Transcript of actin, beta pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP6, Length 1,090 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP6-201ENST00000520036 EFNA5P52803 228 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SMTNP53814 917 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 IGBP1P78318 339 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TLE2Q04725 743 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 MCM6Q14566 821 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 LONRF3Q496Y0 759 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM26DQ5JW98 314 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 METTL13Q8N6R0 699 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 DDX12PQ92771 950 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 GSDMAQ96QA5 445 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PLIN2Q99541 437 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PANK2Q9BZ23 570 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM9Q9C026 710 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PARVGQ9HBI0 331 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 RMND1Q9NWS8 449 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 DACT1Q9NYF0 836 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 NR1I2O75469 434 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM13AO94988 1023 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 KIF20AO95235 890 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 CLTBP09497 229 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PLS3P13797 630 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 RFC2P35250 354 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 ARL2P36404 184 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PHKA2P46019 1235 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PSMD2Q13200 908 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 POSTNQ15063 836 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM60Q495X7 471 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 PAGE5Q96GU1 130 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SUGCTQ9HAC7 445 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 OLFML3Q9NRN5 406 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 AKT3Q9Y243 479 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TCHHQ07283 1943 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTBP6-201ENST00000520036 TMEM150BA6NC51 233 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 KIAA0355O15063 1070 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 HIP1RO75146 1068 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 PFKMP08237 780 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 SELPP16109 830 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 LIG1P18858 919 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 PPP1R2P41236 205 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 ASIC1P78348 528 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 FAAP100Q0VG06 881 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 GIT2Q14161 759 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 KCNB1Q14721 858 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 ARSHQ5FYA8 562 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 UNC13DQ70J99 1090 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIML1Q8N9V2 468 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 SPATA20Q8TB22 786 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 HVCN1Q96D96 273 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 DNAJC19Q96DA6 116 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 CTAGE1Q96RT6 745 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 REEP2Q9BRK0 252 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 HIPK3Q9H422 1215 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TBX21Q9UL17 535 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 CENPFP49454 3210 aa10.08□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 MYMKA6NI61 221 aa10.07□□□□□ -0.8
ACTBP6-201ENST00000520036 EVI5O60447 810 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms