RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MROH8	Q9H579	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPRF	P10586	1907 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	BACH1	O14867	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCP110	O43303	1012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF862	O60290	1169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GCNT3	O95395	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSAP	P07602	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TGFB3	P10600	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLS3	P13797	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTF2A2	P52657	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACTR2	P61160	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERVK-24	P63145	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNA1	Q09470	495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALCAM	Q13740	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYCP1	Q15431	976 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANO5	Q75V66	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDHX	O00330	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	AKAP3	O75969	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NR3C1	P04150	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUBB4A	P04350	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PGK2	P07205	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP2C8	P10632	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNNT1	P13805	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP4A	P20648	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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