RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 TAP1Q03518 808 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 DRP2Q13474 957 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TCP11Q8WWU5 503 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ADAM2Q99965 735 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 A0A087WZ62 844 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 EMC2Q15006 297 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FAM228AQ86W67 206 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 HSCBQ8IWL3 235 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TMEM143Q96AN5 459 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 NLRP4Q96MN2 994 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 NACC1Q96RE7 527 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MTRQ99707 1265 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 TMX1Q9H3N1 280 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 STK24Q9Y6E0 443 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 A0A087WWV3 80 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 LINC01553A4QN01 128 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 RPA1P27694 616 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PDIA5Q14554 519 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 BRAPQ7Z569 592 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ZNF410Q86VK4 478 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 KSR1Q8IVT5 923 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ASAP2O43150 1006 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MED24O75448 989 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 DGAT1O75907 488 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ARHGEF15O94989 841 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PRPHP41219 470 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 RARRES1P49788 294 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FERMT3Q86UX7 667 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FIBCD1Q8N539 461 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SNX21Q969T3 373 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 RGS18Q9NS28 235 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 RFXAPO00287 272 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MGEA5O60502 916 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 FGFR4P22455 802 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 ERVK-21P61565 698 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 KRT79Q5XKE5 535 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 POTEGQ6S5H5 508 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 PPM1EQ8WY54 764 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL28-202ENST00000489442 EYSQ5T1H1 3165 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 DGKIO75912 1065 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 SYT1P21579 422 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 MUTP22033 750 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 TFDP1Q14186 410 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL28-202ENST00000489442 ADGRE1Q14246 886 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms