RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487625.1

USP9X-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 2

Gene USP9X, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-208	ENST00000487625	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	GYPE	P15421	78 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ITGAE	P38570	1179 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ECE1	P42892	770 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.07	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	BPIFB4	P59827	614 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.06	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	CASP7	P55210	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	FHL1	Q13642	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.05	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	CAPNS1	P04632	268 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	HK1	P19367	917 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	OCA2	Q04671	838 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	ESRRB	O95718	433 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	MPL	P40238	635 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP9X-208	ENST00000487625	MGST3	O14880	152 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	NCR1	O76036	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	BMP15	O95972	392 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	ERCC3	P19447	782 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	PROK1	P58294	105 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	RGMA	Q96B86	450 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SOX9	P48436	509 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	NCAPH	Q15003	741 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SV2C	Q496J9	727 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.01	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	STC2	O76061	302 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	NTN1	O95631	604 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GRIA2	P42262	883 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	MPP3	Q13368	585 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GAGE13	Q4V321	117 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	BRAP	Q7Z569	592 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SHD	Q96IW2	340 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	TP73	O15350	636 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	NDUFA10	O95299	355 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SOD2	P04179	222 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	GNAT2	P19087	354 aa		3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
USP9X-208	ENST00000487625	HERVK_113	P62684	666 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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