RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486867.1

SF1-216, Transcript of splicing factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene SF1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1-216ENST00000486867 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 DNAJB2P25686 324 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 ARL2P36404 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 KCNJ6P48051 423 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 POU5F1BQ06416 359 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 DSC3Q14574 896 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 SLC39A14Q15043 492 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 RAB30Q15771 203 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 KRT79Q5XKE5 535 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 FAM228AQ86W67 206 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.67□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 GPR182O15218 404 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 RPS6KA5O75582 802 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 EYA4O95677 639 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 F13A1P00488 732 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 PAK2Q13177 524 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 PKP1Q13835 747 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 TOP1MTQ969P6 601 aa14.66□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.66□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 BRD1O95696 1058 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 CYP11B2P19099 503 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 PBX2P40425 430 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 GRIN1Q05586 938 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 GRB10Q13322 594 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 BECN1Q14457 450 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-216ENST00000486867 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-216ENST00000486867 A0A087WZ62 844 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-216ENST00000486867 FAM189BP81408 668 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-216ENST00000486867 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SF1-216ENST00000486867 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 C9IYK1 514 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 DDIT3P35638 169 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 RABGGTBP53611 331 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 PTENP60484 403 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.078e-8■■□□□ 13.3
SF1-216ENST00000486867 CABP7Q86V35 215 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 KSR1Q8IVT5 923 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 NLRP7Q8WX94 980 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.63□□□□□ -0.07
SF1-216ENST00000486867 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.63□□□□□ -0.07
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