RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.26■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 PFKFB2O60825 505 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 XKR3Q5GH77 459 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 RNF169Q8NCN4 708 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 OXER1Q8TDS5 423 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 NLRP7Q8WX94 980 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 LRFN3Q9BTN0 628 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 FAM50BQ9Y247 325 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 STK36Q9NRP7 1315 aa24.25■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 STBD1O95210 358 aa24.24■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 NDUFV1P49821 464 aa24.24■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.24■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 C11orf16Q9NQ32 467 aa24.24■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 CTDNEP1O95476 244 aa24.23■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 ZP2Q05996 745 aa24.23■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.23■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.23■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 CWH43Q9H720 699 aa24.23■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 ARID2Q68CP9 1835 aa24.22■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 ADAM15Q13444 863 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 NEK8Q86SG6 692 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 NECAB1Q8N987 351 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.22■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 VAV3Q9UKW4 847 aa24.22■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 FAM205CA6NFA0 338 aa24.21■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.21■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 LARGE1O95461 756 aa24.21■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 XBP1P17861 261 aa24.21■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
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USP40-215ENST00000484528 TLR9Q9NR96 1032 aa24.21■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 CD207Q9UJ71 328 aa24.21■■□□□ 1.47
USP40-215ENST00000484528 A0A087WZ62 844 aa24.2■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 LAG3P18627 525 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 ANAPC15P60006 121 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 ERVFC1P60507 584 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 PSMC5P62195 406 aa24.2■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.2■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 ABI1Q8IZP0 508 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.2■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 EFHBQ8N7U6 833 aa24.2■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.19■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 TLE6Q9H808 572 aa24.19■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 CLEC1BQ9P126 229 aa24.19■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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USP40-215ENST00000484528 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
USP40-215ENST00000484528 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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