RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465634.5

TRIM5-208, Transcript of tripartite motif containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene TRIM5, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM5-208	ENST00000465634	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634		H0YCG3	227 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TREH	O43280	583 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	HIP1R	O75146	1068 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM13A	O94988	1023 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CYP2C9	P11712	490 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PLS3	P13797	630 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SMTN	P53814	917 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MAPK7	Q13164	816 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TFDP1	Q14186	410 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CAMK4	Q16566	473 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KCNN1	Q92952	543 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CD4	P01730	458 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	IDE	P14735	1019 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	NAMPT	P43490	491 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	EHHADH	Q08426	723 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PNOC	Q13519	176 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ALCAM	Q13740	583 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	HIC1	Q14526	733 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	DAW1	Q8N136	415 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CENPF	P49454	3210 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KLRC4	O43908	158 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	B4GALT4	O60513	344 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KIF20A	O95235	890 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	GLRA2	P23416	452 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP1R2	P41236	205 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CLCN3	P51790	818 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	EFNA5	P52803	228 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RBL2	Q08999	1139 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	COASY	Q13057	564 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	BFSP2	Q13515	415 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TRIM5-208	ENST00000465634	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7

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