RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 MEIS1O00470 390 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ATP2C2O75185 946 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TRIM37O94972 964 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TMEM253P0C7T8 217 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 IL1R1P14778 569 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CHN1P15882 459 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 FERP16591 822 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PLCG2P16885 1265 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 VCAM1P19320 739 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PSEN1P49768 467 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MMP14P50281 582 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 DR1Q01658 176 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PLS1Q14651 629 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 HOOK3Q86VS8 718 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 JAMLQ86YT9 394 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 NEK9Q8TD19 979 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 GLG1Q92896 1179 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ERP44Q9BS26 406 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MXD3Q9BW11 206 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ANO3Q9BYT9 981 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 RAB17Q9H0T7 212 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 COG5Q9UP83 839 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 AFF2P51816 1311 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.16□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TGFB1I1O43294 461 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TTLL1O95922 423 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SOX5P35711 763 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PTGIRP43119 386 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 GPSM2P81274 684 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MAPK7Q13164 816 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 VPS36Q86VN1 386 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SCLT1Q96NL6 688 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 AMFRQ9UKV5 643 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 FAM170AA1A519 330 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ASAP2O43150 1006 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MARCH6O60337 910 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ATP6V1G2O95670 118 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 GSTA1P08263 222 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 RPA1P27694 616 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 SHMT1P34896 483 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MARCKSL1P49006 195 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 PMS2P54278 862 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 ITIH4Q14624 930 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 AADACL2Q6P093 401 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 KCTD1Q719H9 257 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 C18orf8Q96DM3 657 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 AZI2Q9H6S1 392 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 VAV3Q9UKW4 847 aa7.15□□□□□ -1.26
RARB-204ENST00000458646 FAM187AA6NFU0 413 aa7.14□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MEIS2O14770 477 aa7.14□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CLIC2O15247 247 aa7.14□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RPS6KA4O75676 772 aa7.14□□□□□ -1.27
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