RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF527Q8NB42 609 aa5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.57□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.57□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 ELNP15502 786 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCA1P28370 1054 aa5.56□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF543Q08ER8 600 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 STARD3Q14849 445 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC157Q569K6 752 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.56□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 OXR1Q8N573 874 aa5.56□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPN18Q99952 460 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC45AQ9H3U1 944 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 POFUT1Q9H488 388 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.56□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.56□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.56□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 C22orf46C9J442 243 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC16A6O15403 523 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXP2O15409 715 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FFAR2O15552 330 aa5.55□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 MBD4O95243 580 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP2K6P52564 334 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 LGALS4P56470 323 aa5.55□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 CDK17Q00537 523 aa5.55□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM20Q15388 145 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 MROH9Q5TGP6 573 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 RETSATQ6NUM9 610 aa5.55□□□□□ -1.52
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CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD1Q719H9 257 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPEARQ8WU66 669 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 HDAC10Q969S8 669 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 MAFKO60675 156 aa5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CBX1P4-201ENST00000439415 ALX3O95076 343 aa5.54□□□□□ -1.52
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