RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.2■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 CYP11B2P19099 503 aa16.2■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SHMT1P34896 483 aa16.2■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.18■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 NR2E1Q9Y466 385 aa16.18■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 POTECB2RU33 542 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SLC26A4O43511 780 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SNHG28P0DPA3 235 aa16.17■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 GALCP54803 685 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 POTEBQ6S5H4 581 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NCANO14594 1321 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 KLRC3Q07444 240 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 HOOK2Q96ED9 719 aa16.17■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 GOPCQ9HD26 462 aa16.17■□□□□ 0.18
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TOP3B-206ENST00000436282 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L11C9JVI0 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L18D6R9N7 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L22D6RA61 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L19D6RCP7 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L20D6RJB6 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CASP5P51878 434 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L24Q0WX57 530 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 CARD9Q9H257 536 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.16■□□□□ 0.18
TOP3B-206ENST00000436282 NPR1P16066 1061 aa16.16■□□□□ 0.18
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