RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 EML1O00423 815 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 TBX10O75333 385 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 LETM2Q2VYF4 491 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 MTERF2Q49AM1 385 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 VAV3Q9UKW4 847 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 LINC01565O15544 149 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 LARGE1O95461 756 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 NEK8Q86SG6 692 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 GJD3Q8N144 294 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 CWH43Q9H720 699 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 C5orf42Q9H799 3197 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 FGFR4P22455 802 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PPP2R5CQ13362 524 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM15Q13444 863 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ANO5Q75V66 913 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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HLA-B-250ENST00000434333 ME3Q16798 604 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 HAS1Q92839 578 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 FAM20AQ96MK3 541 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 CASD1Q96PB1 797 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 IGFLR1Q9H665 355 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 FAM205CA6NFA0 338 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 XBP1P17861 261 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PSMC5P62195 406 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ZP2Q05996 745 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ANKRD1Q15327 319 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 NECAB1Q8N987 351 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 NLRP7Q8WX94 980 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 TNFRSF25Q93038 417 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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HLA-B-250ENST00000434333 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.58■■□□□ 1.21
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HLA-B-250ENST00000434333 CLUL1Q15846 466 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 GTF3C6Q969F1 213 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 SCLT1Q96NL6 688 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-250ENST00000434333 AAASQ9NRG9 546 aa22.58■■□□□ 1.21
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HLA-B-250ENST00000434333 A0A0U1RQF3 1178 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 TBX3O15119 743 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 LAG3P18627 525 aa22.57■■□□□ 1.2
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HLA-B-250ENST00000434333 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HLA-B-250ENST00000434333 EFHBQ8N7U6 833 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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HLA-B-250ENST00000434333 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 FAM50BQ9Y247 325 aa22.57■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.56■■□□□ 1.2
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HLA-B-250ENST00000434333 GLP2RO95838 553 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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HLA-B-250ENST00000434333 NPEPPSP55786 919 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 ERVFC1P60507 584 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 TLR9Q9NR96 1032 aa22.56■■□□□ 1.2
HLA-B-250ENST00000434333 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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