RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DAAM2Q86T65 1068 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS36Q86VN1 386 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 19.1
SH3BP1-202ENST00000417536 AMNQ9BXJ7 453 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 35.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MSH4O15457 936 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CLSTN1O94985 981 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 Q4G0T1 1027 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 AMACRQ9UHK6 382 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 INPP5BP32019 993 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC24CP53992 1094 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 JAM2P57087 298 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MRIQ9BWK5 157 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EPN3Q9H201 632 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PSME4Q14997 1843 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX3O15119 743 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R37O75864 691 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CUL1Q13616 776 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO11Q86XK2 927 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EML1O00423 815 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFB2P61812 414 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 DLK2Q6UY11 383 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MKL1Q969V6 931 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF76P36508 570 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT2BQ92831 832 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 NYAP2Q9P242 653 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 NENFQ9UMX5 172 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FLT3P36888 993 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SREBF1P36956 1147 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGISQ16647 500 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA35Q5VZE5 725 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM20AQ96MK3 541 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 VAV3Q9UKW4 847 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 DAPK3O43293 454 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFB1I1O43294 461 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EVI5O60447 810 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ENTPD3O75355 529 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MYZAPP0CAP1 466 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 GALCP54803 685 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KSR1Q8IVT5 923 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGER2P43116 358 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.841e-10■■■■■ 28.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC45Q96CN5 670 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 TTI1O43156 1089 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC10Q5UCC4 262 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MICALL2Q8IY33 904 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MYCT1Q8N699 235 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0754O94854 1291 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EYA4O95677 639 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FERP16591 822 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 STAT1P42224 750 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 RASA3Q14644 834 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YGN5 161 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms