RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYF6P23409 242 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBP1P32455 592 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABL2P42684 1182 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOP2P46087 812 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLRBP48167 497 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLK1P80370 383 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE3CQ15386 1083 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 OCLNQ16625 522 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SKIDA1Q1XH10 827 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM214AQ32MH5 1076 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM201Q5SNT2 666 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCNX4Q63HM2 1172 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFSD5Q6N075 450 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM111BQ6SJ93 734 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJD3Q8N144 294 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARRDC4Q8NCT1 418 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHO2Q8TD55 490 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRIMPOLQ96LW4 560 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCN2Q96RP3 112 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 EGFL8Q99944 293 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM204Q9BSN7 226 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRY4Q9C004 299 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLXIPLQ9NP71 852 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKAP2Q9Y2D5 859 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRBV5S2A0A599 114 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ESYT3A0FGR9 886 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf71A6NGG8 1288 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNU1A8MYU2 1149 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHGR1C9JFL3 82 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXTL3O43909 919 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPDEFO95238 335 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGBP02675 491 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEFLP07196 543 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NGFRP08138 427 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF883P0CG24 379 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF8P28908 595 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 RESTQ13127 1097 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSC3Q14574 896 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFATC4Q14934 902 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEZ6Q53EL9 994 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCSD1Q6JBY9 416 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKBH2Q6NS38 261 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZVH6 145 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIOX2Q8IUF8 465 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLXDC1Q8IUK5 500 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF479Q96JC4 524 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF2CQ99661 725 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM2Q99965 735 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM117AQ9C073 453 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF408Q9H9D4 720 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP4R2Q9NY27 417 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB7CA1YPR0 619 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BNX3 289 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGS13O14921 159 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPHS1O60500 1241 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRMT3O60678 531 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABLIM3O94929 683 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL18BPO95998 194 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 THBDP07204 575 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SP1P08047 785 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLCG1P19174 1290 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRE11P49959 708 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MEOX1P50221 254 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSCR10P59022 87 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMAN2Q12907 356 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 MROH9Q5TGP6 573 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF1DP3Q658K8 133 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUMO4Q6EEV6 95 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMC6Q6NXE6 501 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF549Q6P9A3 640 aa-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms