RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404125.5

PSME4-202, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME4, Length 7,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-202ENST00000404125 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 SOX10P56693 466 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 AP1B1Q10567 949 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 IL31Q6EBC2 164 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 CPA4Q9UI42 421 aa14.71□□□□□ -0.05
PSME4-202ENST00000404125 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 KCNH2Q12809 1159 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 WDR64B1ANS9 1081 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DFFAO00273 331 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GGPS1O95749 300 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SOX5P35711 763 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.71□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CPP00450 1065 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MYL1P05976 194 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ARHGEF6Q15052 776 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 AGR3Q8TD06 166 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 RGL2O15211 777 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GCNAQ96QF7 691 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 LRRC53A6NM62 1247 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MCF2LO15068 1137 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GRIN1Q05586 938 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TOM1L1O75674 476 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GINM1Q9NU53 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CCDC157Q569K6 752 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SHC4Q6S5L8 630 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ATG4CQ96DT6 458 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.7□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 H0YCG3 227 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 INHBAP08476 426 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 USP49Q70CQ1 688 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ATP2A3Q93084 1043 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 VAMP7P51809 220 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TUBB4BP68371 445 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PDIA6Q15084 440 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 BBS9Q3SYG4 887 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PRR23AA6NEV1 266 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MROH2AA6NES4 1674 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ARL4AP40617 200 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CPB2Q96IY4 423 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ERFP50548 548 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SLMAPQ14BN4 828 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 C2CD6Q53TS8 623 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DGKHQ86XP1 1220 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TSKSQ9UJT2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 EMSYQ7Z589 1322 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GYS1P13807 737 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 SPON2Q9BUD6 331 aa14.69□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ADM5C9JUS6 153 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 GJB7Q6PEY0 223 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MS4A14Q96JA4 679 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 NEMP1O14524 444 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 MTF1Q14872 753 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 USP27XA6NNY8 438 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 HUS1O60921 280 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 VTNP04004 478 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 FAF2Q96CS3 445 aa14.68□□□□□ -0.06
PSME4-202ENST00000404125 STK17AQ9UEE5 414 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms