RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 USP38Q8NB14 1042 aa26.04■■□□□ 1.76
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AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF536O15090 1300 aa26.04■■□□□ 1.76
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AMIGO1-201ENST00000369862 PBKQ96KB5 322 aa25.99■■□□□ 1.75
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AMIGO1-201ENST00000369862 NR1D1P20393 614 aa25.99■■□□□ 1.75
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AMIGO1-201ENST00000369862 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 GJB7Q6PEY0 223 aa25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 RIT2Q99578 217 aa25.98■■□□□ 1.75
AMIGO1-201ENST00000369862 EPN3Q9H201 632 aa25.98■■□□□ 1.75
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