RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362425.1

RNU6-1312P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1312, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1312P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NKD1Q969G9 470 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 EGFL8Q99944 293 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF652Q9Y2D9 606 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1312P-201ENST00000362425 C2orf71A6NGG8 1288 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 KCNU1A8MYU2 1149 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 UPK3BL1B0FP48 263 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 UPK3BL2E5RIL1 263 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 H3BNX3 289 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ORC4O43929 436 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NCR1O76036 304 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ABLIM3O94929 683 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HMGCRP04035 888 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TUBB4AP04350 444 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NGFRP08138 427 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF883P0CG24 379 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ITGAMP11215 1152 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FAM189BP81408 668 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PHF19Q5T6S3 580 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SUMO4Q6EEV6 95 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ARMC6Q6NXE6 501 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 WDSUB1Q8N9V3 476 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GSTO2Q9H4Y5 243 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ALG2Q9H553 416 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GULP1Q9UBP9 304 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SQORQ9Y6N5 450 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ESYT3A0FGR9 886 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PLA2G2AP14555 144 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TNFRSF8P28908 595 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GBP1P32455 592 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 BCL6P41182 706 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CDK8P49336 464 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MLLT10P55197 1068 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 FCGRTP55899 365 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TP53BP2Q13625 1128 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 UBXN2BQ14CS0 331 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SKIDA1Q1XH10 827 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF618Q5T7W0 954 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF549Q6P9A3 640 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NLRC3Q7RTR2 1065 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RELL1Q8IUW5 271 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MB21D1Q8N884 522 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 OR14K1Q8NGZ2 314 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GAL3ST3Q96A11 431 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF479Q96JC4 524 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CEP44Q9C0F1 390 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 C12orf49Q9H741 205 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NPHS2Q9NP85 383 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PRR34Q9NV39 138 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RNF181Q9P0P0 153 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 POLIQ9UNA4 740 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TTC3P53804 2025 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 SCN5AQ14524 2016 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 UNC119BA6NIH7 251 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 HGSO14964 777 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 NEFLP07196 543 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GLRBP48167 497 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MEOX1P50221 254 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 MXRA7P84157 204 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 KEAP1Q14145 624 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 TMEM201Q5SNT2 666 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ZNF66Q6ZN08 573 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 GDF7Q7Z4P5 450 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PROSER1Q86XN7 944 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PLXDC1Q8IUK5 500 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 RETREG2Q8NC44 543 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 C16orf52Q8NHV5 167 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PLEKHO2Q8TD55 490 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 Q96MF0 132 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1312P-201ENST00000362425 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms