RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 FAM13AO94988 1023 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 SMC2O95347 1197 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 SERINC5Q86VE9 423 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC65Q8IXS2 484 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 GPRC5CQ9NQ84 441 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 C17orf75Q9HAS0 396 aa30.77■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TLR3O15455 904 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 B4GALT4O60513 344 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ARL2P36404 184 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SOX10P56693 466 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RTP1P59025 263 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK7Q13164 816 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PTK7Q13308 1070 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 UNC13DQ70J99 1090 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ZHX3Q9H4I2 956 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PARVGQ9HBI0 331 aa30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 MYH11P35749 1972 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RSPH10BP0C881 870 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF131P52739 623 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DRP2Q13474 957 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RUFY4Q6ZNE9 571 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RSPH3Q86UC2 560 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DAW1Q8N136 415 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCE1Q969G3 411 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PANK4Q9NVE7 773 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM63CQ9P1W3 806 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 AKT3Q9Y243 479 aa30.75■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 FRMD3A2A2Y4 597 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 GAP43P17677 238 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 NME8Q8N427 588 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 IFT74Q96LB3 600 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 TOX2Q96NM4 488 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 POLD4Q9HCU8 107 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KCNG1Q9UIX4 513 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ASAP2O43150 1006 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RPN1P04843 607 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R5AQ15172 486 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 GSDMAQ96QA5 445 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa30.74■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC85CA6NKD9 419 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PLS3P13797 630 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CDC42EP1Q00587 391 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 MYCT1Q8N699 235 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA20Q8TB22 786 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJB3Q8WWF6 145 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SEL1LQ9UBV2 794 aa30.73■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SFI1A8K8P3 1242 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DCDC2CA8MYV0 355 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM60Q495X7 471 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RHPN2Q8IUC4 686 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 EXOC1Q9NV70 894 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RMND1Q9NWS8 449 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1468Q9P260 1216 aa30.72■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KLRC4O43908 158 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CD4P01730 458 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 COASYQ13057 564 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ODR4Q5SWX8 454 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 RPAINQ86UA6 219 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 GLRA2P23416 452 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 TFDP1Q14186 410 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KCNB1Q14721 858 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 NT5DC1Q5TFE4 455 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ASAP3Q8TDY4 903 aa30.71■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 VTNP04004 478 aa30.7■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 KMT5BQ4FZB7 885 aa30.7■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 SFR1Q86XK3 245 aa30.7■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa30.7■■■□□ 2.51
GIPC1-201ENST00000345425 CAND2O75155 1236 aa30.69■■■□□ 2.5
GIPC1-201ENST00000345425 NAMPTP43490 491 aa30.69■■■□□ 2.5
GIPC1-201ENST00000345425 SARSP49591 514 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
GIPC1-201ENST00000345425 SMTNP53814 917 aa30.69■■■□□ 2.5
GIPC1-201ENST00000345425 PEX3P56589 373 aa30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms