RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	TYRO3	Q06418	890 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFSD10	Q14728	455 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC41	Q15345	812 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAW1	Q8N136	415 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZEB2	O60315	1214 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KPNA6	O60684	536 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIP1R	O75146	1068 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSEN2	P49810	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF445	P59923	1031 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAS3	O00219	553 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	COASY	Q13057	564 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPK7	Q13164	816 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MORC3	Q14149	939 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNB1	Q14721	858 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMC2	Q15006	297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM13A	O94988	1023 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	EHHADH	Q08426	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIK4	Q16099	956 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFC5	P40937	340 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK4	Q13043	487 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DRP2	Q13474	957 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDA	Q9Y2T3	454 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLRC1	P26715	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF131	P52739	623 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACLY	P53396	1101 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	C22orf31	O95567	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP12	P59046	1061 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	STX1A	Q16623	288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL13	Q8N6R0	699 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIC1	Q14526	733 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms