RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	HPSE	Q9Y251	543 aa		27.57	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	EVI5	O60447	810 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DNM2	P50570	870 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	EMC2	Q15006	297 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DPF3	Q92784	378 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DHX58	Q96C10	678 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	NDUFA8	P51970	172 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MCM6	Q14566	821 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	E2F4	Q16254	413 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RSPH3	Q86UC2	560 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SYK	P43405	635 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MTR	Q99707	1265 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	ARID2	Q68CP9	1835 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CYP11B2	P19099	503 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CLCN3	P51790	818 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	UBE2H	P62256	183 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	BFSP2	Q13515	415 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	NME8	Q8N427	588 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	WNT8B	Q93098	351 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MAP7D2	Q96T17	732 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	KCND2	Q9NZV8	630 aa		27.54	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RGS19	P49795	217 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TCP11	Q8WWU5	503 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	USP25	Q9UHP3	1055 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	THPO	P40225	353 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	AKT3	Q9Y243	479 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CAND2	O75155	1236 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	IER5	Q5VY09	327 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM143	Q96AN5	459 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	SLFN14	P0C7P3	912 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	RBL2	Q08999	1139 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	DRP2	Q13474	957 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	ALPK3	Q96L96	1907 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	CKB	P12277	381 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	GUCY2C	P25092	1073 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	TNMD	Q9H2S6	317 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF202	O95125	648 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	ARSH	Q5FYA8	562 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM259-208	ENST00000592052		M0QZ92	97 aa		27.49	■■□□□ 1.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms