RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CWH43Q9H720 699 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM189BP81408 668 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 DSC3Q14574 896 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL13Q8N6R0 699 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM161AQ9NX61 479 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FSCN2O14926 492 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RCAN1P53805 252 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP6Q16828 381 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D22BQ9NU19 505 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ESYT2A0FGR8 921 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN3P51790 818 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SETQ01105 290 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM67Q6ZTA4 783 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GABBR1Q9UBS5 961 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA1P15085 419 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LAG3P18627 525 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.244e-11■□□□□ 10.1
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CAPNS1-211ENST00000590874 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD6Q92537 303 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF19AQ9NV58 838 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PIEZO1Q92508 2521 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TECTAO75443 2155 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM221A6NGB7 291 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R296 226 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PSAPP07602 524 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZXDAP98168 799 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT32Q14532 448 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PKN1Q16512 942 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR16Q569H4 304 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNC3Q14003 757 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP4Q5VZY2 271 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01465Q8N7H1 131 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CASD1Q96PB1 797 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM117Q9H0C3 514 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf50Q9HD87 102 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-211ENST00000590874 PLCB3Q01970 1234 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC71Q8N4P6 559 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LENG9Q96B70 501 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS10Q9H324 1103 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 AKT3Q9Y243 479 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LZTS1Q9Y250 596 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FSD2A1L4K1 749 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PBX3P40426 434 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FGD1P98174 961 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 IER5LQ5T953 404 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MCTP2Q6DN12 878 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS33Q8NF86 280 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF25Q9BQ70 676 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMM50Q9Y512 469 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB2O15479 319 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF862O60290 1169 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CIITAP33076 1130 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZUG5 572 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM167AQ96KS9 214 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP7D2Q96T17 732 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 S1PR5Q9H228 398 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NID2Q14112 1375 aa29.01■■■□□ 2.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIOO75962 3097 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HIDE1A8MVS5 230 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TECP42680 631 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNT2Q6UVM3 1135 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC43Q8N309 656 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 BRF1Q92994 677 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PHKBQ93100 1093 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PHOX2BQ99453 314 aa29.01■■■□□ 2.23
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