RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 VPS16Q9H269 839 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 POLD4Q9HCU8 107 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PPME1Q9Y570 386 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQC6 194 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SORBS3O60504 671 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TLR2O60603 784 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DGAT1O75907 488 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TPM2P07951 284 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 RTP1P59025 263 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 IRF5Q13568 498 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DPP9Q86TI2 863 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 KIFAP3Q92845 792 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MAML3Q96JK9 1138 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 STAT5BP51692 787 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP89Q96ST8 783 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DNM2P50570 870 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID5BQ14865 1188 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MIIPQ5JXC2 388 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM167AQ96KS9 214 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 EMSYQ7Z589 1322 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CETN3O15182 167 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFB1I1O43294 461 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXC6P09630 235 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NCKAP1LP55160 1127 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LRMPQ12912 555 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM9Q13443 819 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MAN2A1Q16706 1144 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 USP6NLQ92738 828 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNN1Q92952 543 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TOMM70O94826 608 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2BQ00403 316 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 UBXN1Q04323 297 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP1Q07960 439 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2K5Q13163 448 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMC2Q13753 1193 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 MYBPC2Q14324 1141 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 HVCN1Q96D96 273 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TINF2Q9BSI4 451 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RFC5P40937 340 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A2P50443 739 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CCZ1BP86790 482 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNA1Q09470 495 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM14Q14142 442 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 VWA3BQ502W6 1294 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA33Q96N06 139 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TMX1Q9H3N1 280 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 AZI2Q9H6S1 392 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM206Q9H813 350 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRC5CQ9NQ84 441 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 K7ENM7 598 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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