RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 HERVK_113Q902F9 699 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.47■□□□□ 0.55
HACE1-211ENST00000521962 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.47■□□□□ 0.55
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HACE1-211ENST00000521962 A0A087WWV3 80 aa18.46■□□□□ 0.55
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HACE1-211ENST00000521962 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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HACE1-211ENST00000521962 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.45■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.45■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 CEP170P1Q96L14 293 aa18.45■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.45■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 ZNF576Q9H609 170 aa18.45■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 TIFAQ96CG3 184 aa18.44■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 SUGCTQ9HAC7 445 aa18.44■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.44■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 BMP15O95972 392 aa18.43■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.43■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 PPME1Q9Y570 386 aa18.43■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 AKT3Q9Y243 479 aa18.42■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 BAIAP3O94812 1187 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 BRD1O95696 1058 aa18.41■□□□□ 0.54
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HACE1-211ENST00000521962 MUTP22033 750 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 CD52P31358 61 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 GPC3P51654 580 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 HYIQ5T013 277 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.41■□□□□ 0.54
HACE1-211ENST00000521962 KCNK18Q7Z418 384 aa18.41■□□□□ 0.54
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