RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505970.2

ANKRD55-204, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD55, Length 853 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-204ENST00000505970 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 FBXL16Q8N461 479 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 BANK1Q8NDB2 785 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 UIMC1Q96RL1 719 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 GINS2Q9Y248 185 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SAMM50Q9Y512 469 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SQORQ9Y6N5 450 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.77□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 WDR64B1ANS9 1081 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CPLX1O14810 134 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ADAMTS3O15072 1205 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PPFIA3O75145 1194 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CSPG5O95196 566 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PSAPP07602 524 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 STAG3L1P0CL83 205 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NLRP5P59047 1200 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NTRK3Q16288 839 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 RUFY3Q7L099 469 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 FAM167AQ96KS9 214 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PADI3Q9ULW8 664 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.76□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TK2O00142 265 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CHMP2AO43633 222 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 GAS7O60861 476 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 DGKIO75912 1065 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 DEXIO95424 95 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 C22orf31O95567 290 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 MMP1P03956 469 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 KLRC1P26715 233 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PRKCEQ02156 737 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ODR4Q5SWX8 454 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NME8Q8N427 588 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LENG9Q96B70 501 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 MAP7D2Q96T17 732 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 DENND3A2RUS2 1198 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ENPP3O14638 875 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 RPS6KA5O75582 802 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 VTNP04004 478 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 OATP04181 439 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 RB1P06400 928 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LINC00271P0C7V0 271 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CIITAP33076 1130 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 JAK3P52333 1124 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 EVCP57679 992 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 STK3Q13188 491 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 METTL13Q8N6R0 699 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 SCLT1Q96NL6 688 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 OSMRQ99650 979 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PLVAPQ9BX97 442 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 TTC28Q96AY4 2481 aa9.74□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD55-204ENST00000505970 GRM6O15303 877 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms