RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ANP32CO43423 234 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MAFKO60675 156 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FGF18O76093 207 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 BAIAP3O94812 1187 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF205O95201 554 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GNAT1P11488 350 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 VAV1P15498 845 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 BCL6P41182 706 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 USP11P51784 963 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FIGNQ5HY92 759 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RTP2Q5QGT7 225 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NLRP10Q86W26 655 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DDX11Q96FC9 970 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 JAM3Q9BX67 310 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ANO3Q9BYT9 981 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.74□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 A0A088AWK7 358 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 POM121BA6NF01 834 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 H7BY64 318 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FFAR2O15552 330 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PPFIA3O75145 1194 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 EOMESO95936 686 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 LPLP06858 475 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NID1P14543 1247 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FNTBP49356 437 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ARL4CP56559 192 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 DUSP4Q13115 394 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PMS2P11Q13670 270 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PRKG1Q13976 671 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ACAD11Q709F0 780 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CNPY4Q8N129 248 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RNF152Q8N8N0 203 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TTC14Q96N46 770 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RMDN3Q96TC7 470 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KMT5AQ9NQR1 393 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ERBB4Q15303 1308 aa5.73□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 AREL1O15033 823 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 THP07101 528 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GSTM1P09488 218 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 COL6A2P12110 1019 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KIR3DL1P43629 444 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 HSPA7P48741 367 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 BCAR1P56945 870 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RAB1AP62820 205 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 APBA1Q02410 837 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 POSTNQ15063 836 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TAF12Q16514 161 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 MPEG1Q2M385 716 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms