RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 COPS6Q7L5N1 327 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HOOK3Q86VS8 718 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ERP27Q96DN0 273 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 GBP5Q96PP8 586 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CORO1BQ9BR76 489 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ABCC12Q96J65 1359 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 FAM196BA6NMK8 535 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 BAG3O95817 575 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CDK17Q00537 523 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CUL1Q13616 776 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 AADACL2Q6P093 401 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 USP21Q9UK80 565 aa9.26□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 KRIT1O00522 736 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ABLIM1O14639 778 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 TBX10O75333 385 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 DESP17661 470 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PDE6CP51160 858 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 GALK1P51570 392 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PLTPP55058 493 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 RCN1Q15293 331 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 NAB2Q15742 525 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CHRNA2Q15822 529 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 LONRF1Q17RB8 773 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 VWA3BQ502W6 1294 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 C14orf80Q86SX3 495 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 MIPEPQ99797 713 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 TIPINQ9BVW5 301 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 VCXQ9H320 206 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 KRT82Q9NSB4 513 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CHKBQ9Y259 395 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SNX24Q9Y343 169 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 RPTORQ8N122 1335 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 WFS1O76024 890 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SUN1O94901 812 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PYGMP11217 842 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 IFNAR1P17181 557 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 YY1P25490 414 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 FOXN2P32314 431 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 GIT2Q14161 759 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 VSTM1Q6UX27 236 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 C8orf37Q96NL8 207 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM120BA0PK00 339 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PLSCR1O15162 318 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 LYNP07948 512 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ITGA2BP08514 1039 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 IGBP1P78318 339 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 NPY5RQ15761 445 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 PKN1Q16512 942 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 NCSTNQ92542 709 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 IFT74Q96LB3 600 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 FMO2Q99518 471 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.24□□□□□ -0.93
VWA3B-220ENST00000495571 ASLP04424 464 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms