RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MSH2	P43246	934 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	AP1G2	O75843	785 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LDHC	P07864	332 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPH	P41219	470 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	GRM4	Q14833	912 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	JAML	Q86YT9	394 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TOM1	O60784	492 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PJA2	O43164	708 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP4	P49662	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MTM1	Q13496	603 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	UBXN2A	P68543	259 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CETN1	Q12798	172 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MYH6	P13533	1939 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CD302	Q8IX05	232 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KYNU	Q16719	465 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA21	Q7Z572	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT5	P13647	590 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	FER	P16591	822 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CDK8	P49336	464 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	CCT6B	Q92526	530 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNB1	P01574	187 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	MYB	P10242	640 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ERCC3-208	ENST00000491292	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71

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