RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471582.5

COL20A1-205, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 1,924 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1-205ENST00000471582 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 IL31RAQ8NI17 732 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 STRA6Q9BX79 667 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TSKSQ9UJT2 592 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ATP8B3O60423 1300 aa20.38■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 LYPLA2O95372 231 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 VCAM1P19320 739 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SLC9A1P19634 815 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 VSNL1P62760 191 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MYBPC2Q14324 1141 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 BANK1Q8NDB2 785 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CAGE1Q8TC20 777 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SPAG5Q96R06 1193 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PICK1Q9NRD5 415 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DMAC2Q9NW81 257 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 GGA3Q9NZ52 723 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CLIC2O15247 247 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PPP1R37O75864 691 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 FLOT1O75955 427 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PRKCIP41743 596 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MAPK7Q13164 816 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ALCAMQ13740 583 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 WRNIP1Q96S55 665 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 POLD4Q9HCU8 107 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.37■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ACTN1P12814 892 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MTMR1Q13613 665 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 NAB2Q15742 525 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HDXQ7Z353 690 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CREG2Q8IUH2 290 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CPXCR1Q8N123 301 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SIX2Q9NPC8 291 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 GCNT4Q9P109 453 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PARP14Q460N5 1801 aa20.36■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 A0A087X0T9 212 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZBED4O75132 1171 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HIP1RO75146 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 FAM228BP0C875 321 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MTMR2Q13614 643 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PPP2R5AQ15172 486 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PADI6Q6TGC4 694 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DAW1Q8N136 415 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 L1RE1Q9UN81 338 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 MYH11P35749 1972 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 JAM2P57087 298 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TIPINQ9BVW5 301 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ABCB6Q9NP58 842 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.35■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF185O15231 689 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PGM5Q15124 567 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 RUBCNQ92622 972 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.34■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ARID5AQ03989 594 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 PTK2Q05397 1052 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 SPP2Q13103 211 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 TERF2Q15554 542 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 GPR162Q16538 588 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.33■□□□□ 0.85
COL20A1-205ENST00000471582 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms