RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	STAM	Q92783	540 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTR	Q99707	1265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A1W2PQY0	241 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM13A	O94988	1023 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	IDE	P14735	1019 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	GAP43	P17677	238 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLRC1	P26715	233 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMOD1	P28289	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGBP1	P78318	339 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	DPYD	Q12882	1025 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PNOC	Q13519	176 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	CUL4B	Q13620	913 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	GIT2	Q14161	759 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	EMC2	Q15006	297 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	IER5	Q5VY09	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIP1R	O75146	1068 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	C22orf31	O95567	290 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	HOXC8	P31273	242 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RTP1	P59025	263 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNB1	Q14721	858 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	METTL13	Q8N6R0	699 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARVCF	O00192	962 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ASAP2	O43150	1006 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLS3	P13797	630 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	CASP1	P29466	404 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARL2	P36404	184 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF131	P52739	623 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADAM17	P78536	824 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSMD2	Q13200	908 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SH3BP4-208	ENST00000462602	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74

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