RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 MAP7D2Q96T17 732 aa20.38■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.38■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 DNM3Q9UQ16 869 aa20.38■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 KAT6AQ92794 2004 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 HYIQ5T013 277 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 CALML4Q96GE6 196 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 IL23AQ9NPF7 189 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 AKT3Q9Y243 479 aa20.37■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.36■□□□□ 0.85
PTX4-202ENST00000440447 DGAT1O75907 488 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.34■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTX4-202ENST00000440447 KCNK18Q7Z418 384 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 SCLT1Q96NL6 688 aa20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 SQORQ9Y6N5 450 aa20.32■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 CEP290O15078 2479 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 GPR32O75388 356 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 GHRP10912 638 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 ACTN1P12814 892 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 PLCG1P19174 1290 aa20.31■□□□□ 0.84
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