RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384344.1

RNU6-39P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 39, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-39P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-39P-201ENST00000384344 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZMAT4Q9H898 229 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 Q9UFV3 132 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 NOBOXO60393 691 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 COL6A1P12109 1028 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ETV4P43268 484 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KCNQ1P51787 676 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 CD83Q01151 205 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 MOGSQ13724 837 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 TERF2Q15554 542 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 BROXQ5VW32 411 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KANK2Q63ZY3 851 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 NUDT11Q96G61 164 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 AJUBAQ96IF1 538 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KCNC2Q96PR1 638 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 MSRAQ9UJ68 235 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-39P-201ENST00000384344 TGM5O43548 720 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 KDM1AO60341 852 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 INHBBP09529 407 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 RGS3P49796 1198 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 TMPRSS15P98073 1019 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 STAT4Q14765 748 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 DGKDQ16760 1214 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 UBXN11Q5T124 520 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 STRA8Q7Z7C7 330 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 RASSF3Q86WH2 238 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 SYT8Q8NBV8 401 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 MYL10Q9BUA6 226 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 POFUT1Q9H488 388 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 JADE2Q9NQC1 790 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZNF536O15090 1300 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 TEPSINQ96N21 525 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 KATNBL1Q9H079 304 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 VWA7Q9Y334 891 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 GPR39O43194 453 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 NRP2O60462 931 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 CSF2RBP32927 897 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 CNR2P34972 360 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ID4P47928 161 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 MYBPC3Q14896 1274 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 MAN2A1Q16706 1144 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 LPPQ93052 612 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 DYDC2Q96IM9 177 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 ACAP3Q96P50 834 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 MTG2Q9H4K7 406 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-39P-201ENST00000384344 WASHC2AQ641Q2 1341 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms