RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS18Q9NS28 235 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNX27Q96L92 541 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM260Q9NX78 707 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMCO2A6NFE2 343 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR182O15218 404 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 HBP1O60381 514 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MGEA5O60502 916 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVFC1P60507 584 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASIC4Q96FT7 647 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ATG7O95352 703 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARP10275 920 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN21Q16825 1174 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP55Q53EZ4 464 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHKBQ93100 1093 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 LZTS1Q9Y250 596 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 C9IYK1 514 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPLX1O14810 134 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 BACH1O14867 736 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNAR1P17181 557 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 AVPR2P30518 371 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 AP3B2Q13367 1082 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ESYT2A0FGR8 921 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FSCN2O14926 492 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAG3P18627 525 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TECP42680 631 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB33Q86T24 672 aa21.73■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 S1PR5Q9H228 398 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL1A2P08123 1366 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MEIS1O00470 390 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 GFRA3O60609 400 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM189BP81408 668 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLCB3Q01970 1234 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 STK3Q13188 491 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNC3Q14003 757 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCF25Q9BQ70 676 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 CWH43Q9H720 699 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 C6orf50Q9HD87 102 aa21.72■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 HCSTQ9UBK5 93 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FGFR1P11362 822 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PGBD1Q96JS3 809 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCNE2O96020 404 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNA11P29992 359 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUBP1P53384 320 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT17Q04695 432 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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