RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 RUSC1Q9BVN2 902 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 TIPINQ9BVW5 301 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 GAS2O43903 313 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 SLC43A3Q8NBI5 491 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MCPH1Q8NEM0 835 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MTRQ99707 1265 aa30.87■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ARVCFO00192 962 aa30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 C22orf31O95567 290 aa30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 KRT18P05783 430 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 COL6A1P12109 1028 aa30.86■■■□□ 2.53
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GIPC1-201ENST00000345425 EMC2Q15006 297 aa30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL40Q2TBA0 621 aa30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MTHFD1LQ6UB35 978 aa30.86■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM17P78536 824 aa30.85■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH8Q5T0T0 291 aa30.85■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
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GIPC1-201ENST00000345425 ABHD8Q96I13 439 aa30.85■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 C11orf49Q9H6J7 331 aa30.85■■■□□ 2.53
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GIPC1-201ENST00000345425 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 MYMKA6NI61 221 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ARSHQ5FYA8 562 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 C7orf25Q9BPX7 421 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM9Q9C026 710 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 PDLIM7Q9NR12 457 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa30.84■■■□□ 2.53
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GIPC1-201ENST00000345425 NECAB2Q7Z6G3 386 aa30.84■■■□□ 2.53
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GIPC1-201ENST00000345425 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 CLSTN2Q9H4D0 955 aa30.84■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 CNNM4Q6P4Q7 775 aa30.83■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 ODF2LQ9ULJ1 636 aa30.83■■■□□ 2.53
GIPC1-201ENST00000345425 EN2P19622 333 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TMOD1P28289 359 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 DNM2P50570 870 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 HIC1Q14526 733 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 EFCAB12Q6NXP0 572 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 DYMQ7RTS9 669 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 METTL13Q8N6R0 699 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TCP11Q8WWU5 503 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 SUGCTQ9HAC7 445 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 MROH7Q68CQ1 1323 aa30.82■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 TREHO43280 583 aa30.81■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 ASIC1P78348 528 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CUL4BQ13620 913 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 GIT2Q14161 759 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 FAM102BQ5T8I3 360 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 MAEAQ7L5Y9 396 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 KIFAP3Q92845 792 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 DRC1Q96MC2 740 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 BLZF1Q9H2G9 400 aa30.81■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CYP2C9P11712 490 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CAMK4Q16566 473 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 PTGISQ16647 500 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf53Q5VUE5 145 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TAF2Q6P1X5 1199 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC71Q8N4P6 559 aa30.8■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC19Q96DA6 116 aa30.8■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 HIP1RO75146 1068 aa30.79■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TBCAO75347 108 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB10Q96DT7 871 aa30.79■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 LINC01465Q8N7H1 131 aa30.79■■■□□ 2.52
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GIPC1-201ENST00000345425 EVPLQ92817 2033 aa30.79■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 IDEP14735 1019 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CASP1P29466 404 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CLCN3P51790 818 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 DPYDQ12882 1025 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 SNX17Q15036 470 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TNS4Q8IZW8 715 aa30.78■■■□□ 2.52
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM143Q96AN5 459 aa30.78■■■□□ 2.52
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