RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 OSBPP22059 807 aa29.47■■■□□ 2.31
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HOXD8-201ENST00000313173 K7ENM7 598 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD8-201ENST00000313173 COPB2P35606 906 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD8-201ENST00000313173 ACTR2P61160 394 aa29.46■■■□□ 2.31
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HOXD8-201ENST00000313173 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
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HOXD8-201ENST00000313173 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 DMAC2Q9NW81 257 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.43■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 SYCP3Q8IZU3 236 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 RRAGAQ7L523 313 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 CEP170P1Q96L14 293 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 ACCSQ96QU6 501 aa29.41■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC53A6NM62 1247 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 NCKAP1LP55160 1127 aa29.4■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 CRACR2AQ9BSW2 395 aa29.4■■■□□ 2.3
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HOXD8-201ENST00000313173 GTF2BQ00403 316 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 KIF5CO60282 957 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 SORBS3O60504 671 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 ATG7O95352 703 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP25P42331 645 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 KRT83P78385 493 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD8-201ENST00000313173 HAUS6Q7Z4H7 955 aa29.39■■■□□ 2.3
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