RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A7Q9Y666 1083 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NFASCO94856 1347 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ODR4Q5SWX8 454 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R16BQ96T49 567 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf112Q9NSG2 853 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 HCSTQ9UBK5 93 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1671Q9BY89 1806 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ARP10275 920 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF15Q12870 199 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP6Q16828 381 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM102BQ5T8I3 360 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PLPP4Q5VZY2 271 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TMTC3Q6ZXV5 915 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 VN1R2Q8NFZ6 395 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM86C1Q9NVL1 165 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVFC1P60507 584 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM160B1Q5W0V3 765 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MICU3Q86XE3 530 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8B4Q8TF62 1192 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 APOL5Q9BWW9 433 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ST18O60284 1047 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 HBP1O60381 514 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TECP42680 631 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A2P50443 739 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 NAPAP54920 295 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBRQ0VD83 1088 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC24A5Q71RS6 500 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SUSD6Q92537 303 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CDHR5Q9HBB8 845 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS18Q9NS28 235 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR182O15218 404 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LAG3P18627 525 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SP100P23497 879 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF76P36508 570 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 VCPP55072 806 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP55Q53EZ4 464 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LLGL2Q6P1M3 1020 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM40Q8WWA1 233 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC2Q9BYS8 371 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFR1P11362 822 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LIFRP42702 1097 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN21Q16825 1174 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 WWC2Q6AWC2 1192 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCBQ8NB91 859 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO3Q9BYT9 981 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 C9IYK1 514 aa31.16■■■□□ 2.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 PDXDC2PQ6P474 469 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX27Q96L92 541 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 OSMRQ99650 979 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FSCN2O14926 492 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 GFRA3O60609 400 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FOSP01100 380 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD54Q6NXT1 300 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CKAP2LQ8IYA6 745 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ASIC4Q96FT7 647 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF25Q9BQ70 676 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 RIC8AQ9NPQ8 531 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF302Q9NR11 478 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM161AQ9NX61 479 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG7O95352 703 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNE2O96020 404 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF484Q5JVG2 852 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 COL1A2P08123 1366 aa31.14■■■□□ 2.58
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CAPNS1-217ENST00000629983 AVPR2P30518 371 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM228AQ86W67 206 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R18Q6NYC8 613 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD15Q6UXT9 468 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL13Q8N6R0 699 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa31.12■■■□□ 2.57
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