RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 FGD2Q7Z6J4 655 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3KBP1Q96B97 665 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP69A5D8W1 941 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO1DO94832 1006 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPAP49450 140 aa19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 DDIASQ8IXT1 998 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 MED23Q9ULK4 1368 aa19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 STK32BQ9NY57 414 aa19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 CYTH1Q15438 398 aa19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF15Q66K64 600 aa19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 THAP11Q96EK4 314 aa19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.86■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 TOM1O60784 492 aa19.85■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 NFU1Q9UMS0 254 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 CCND2P30279 289 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCD1P33897 745 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa19.85■□□□□ 0.77
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PTPRJ-207ENST00000613246 USP17L12C9JPN9 530 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 USP17L21D6R901 530 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 VPS11Q9H270 941 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 PIK3R2O00459 728 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 MARK3P27448 753 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 LUZP2Q86TE4 346 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 CYGBQ8WWM9 190 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 SPDYAQ5MJ70 313 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT39Q6A163 491 aa19.84■□□□□ 0.77
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