RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 RHOVQ96L33 236 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 BACH2Q9BYV9 841 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CD320Q9NPF0 282 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PRRG2O14669 202 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 GNAI3P08754 354 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CTGFP29279 349 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MCAMP43121 646 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SOX10P56693 466 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ERVFC1P60507 584 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 VPS37DQ86XT2 251 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 IDI2Q9BXS1 227 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.59□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 MAST3O60307 1309 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 PLXNB2O15031 1838 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 B8ZZF3 427 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FKTNO75072 461 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CBX7O95931 251 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 RECKO95980 971 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 GNAI2P04899 355 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 RGS3P49796 1198 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 INHBEP58166 350 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ATP8B2P98198 1209 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 MECOMQ03112 1051 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TNFAIP1Q13829 316 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 HDXQ7Z353 690 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 UBE2FQ969M7 185 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TMEM74Q96NL1 305 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 USP40Q9NVE5 1235 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 BTBD19C9JJ37 291 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 GFRA2O00451 464 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 F13A1P00488 732 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 INHBBP09529 407 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TMEM253P0C7T8 217 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 GARTP22102 1010 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TNNI2P48788 182 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TCP10Q12799 353 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 PPIL2Q13356 520 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 KCNA10Q16322 511 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CCL15Q16663 113 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 CEP85Q6P2H3 762 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 TTC6Q86TZ1 520 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FBXO27Q8NI29 283 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 PANK1Q8TE04 598 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 WRNIP1Q96S55 665 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 GPR108Q9NPR9 543 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 MYH1P12882 1939 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 LAMA3Q16787 3333 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 FAM221AA4D161 298 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-212ENST00000597259 ENTPD3O75355 529 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms